Genome -Avicennia rumphiana

Avicennia rumphiana

Genome assemblies  Post Date : 4/10/2023

Local name: แสมขน

Location: Prachuap Khiri Khan, Thailand

Method: 10x Genomics sequencing technology

Assembly level: Scaffold

BioProject: PRJNA797928

Genome sequence: ASM4214029v1

Annotation Data (Download): gff3, CDS, Protein

Publication: Assembly of the salt-secreting mangrove Avicennia rumphiana

ลักษณะทางสัณฐานวิทยา (morphology) ของแสมขน; (ซ้าย) ใบ; (ขวาบน) ดอก; (ขวาล่าง) ผล

Choloplast genome

Accession: NC_061403.1

Type: circular

Length: 148264 bp

Publication: Comparative Analysis and Phylogenetic Relationships of Ceriops Species (Rhizophoraceae) and Avicennia lanata (Acanthaceae): Insight into the Chloroplast Genome Evolution between Middle and Seaward Zones of Mangrove Forests

คำอธิบายภาพ: แผนภาพ Chloroplast genome ของแสมขน (Avicennia rumphiana) โดยวงนอกสุดแสดงตำแหน่งที่ตั้งของยีนบน Chloroplast genome ยีนที่แสดงอยู่ด้านนอกของวงจะถูกถอดรหัสในทิศตามเข็มนาฬิกา ส่วนยีนที่อยู่ด้านในจะถูกถอดรหัสในทิศทวนเข็มนาฬิกา โดยยีนที่อยู่ใน functional group ที่ต่างกันจะแสดงด้วยสีที่ต่างกัน; แถบสีเทาเข้มแสดงค่า GC content ส่วนแถบสีเทาอ่อนแสดงค่า AT content ของจีโนม

Mangrove genome project
Genome assemblies